Στα νησιά μικρού και μεσαίου μεγέθους του Αιγαίου (με εξαιρέσεις τα μεγαλύτερα νησιά όπως Κρήτη, Κύπρος και Ρόδος) όπως επίσης και στα ορεινά η Τούρκικη κυριαρχία ήταν πολύ πολύ χαλαρή.Τα νησιά ήταν σε μεγάλο βαθμό σε σημείο να αυτοδιοικουνται επί Τουρκοκρατίας, πολλοί νησιώτες ζούσαν και πέθαιναν χωρίς να έχουν.δει Τούρκο από κοντά.Γι αυτό στα νησιά οι εξισλαμισμοί ήταν απειροελάχιστοι.
Εξισλαμισμοί συνέβαιναν κυρίως στην ηπειρωτική
χώρα και εκεί κυρίως στα Πεδινά χωριά και στα αστικά κέντρα.Και επίσης στα πολύ μεγάλα νησιά όπως Κρήτη, Ρόδος και Κύπρος.