H ιστορική συκοφαντία των Ποντίων από τους Σλαβομακεδόνες.

[Maejima]

Πόσα δείγματα Ελλήνων της Τραπεζούντας μέτρησαν;
Με τι δείγματα αξιολόγησαν το κρητικό γονιδίωμα;
υπάρχει σύγκριση με αλλους Ελληνες;
οταν λες βουλγαρικό γονιδίωμα το οποίο είναι ίδιο με το σκοπιανό πως θα μπορούσε να είναι διαφορετικό αφού μιλάνε ίδια γλώσσα και είναι απ οτην ιδια περιοχή και έχουν ιδια ιστορία;

Είναι ακαδημαϊκά αυτοσωμικά (autosomal) samples που ανεβάζουν τα πανεπιστήμια από papers στο 1000Genomes και αλλού για να τα κάνουν οι υπόλοιποι της ακαδημαϊκής κοινότητας cross reference.

Ο τυπάς στο Eurogenes τα μετατρέπει σε 25 συντεταγμένες για απεικόνιση σε PCA όπως τους VahaduoJ, για να μην μπετώνουμε με το admixtools. Νομίζω τα Greek Trabzon είναι καμμιά 10αριά, εγώ χρησιμοποιήσα τα averages, υπάρχει μικρή διακύμανση που φτιάχνει ένα cluster. Τα Greek_Crete είναι από τον Λαζαρίδη και από μία παλαιότερη έρευνα. Ακαδημαϊκά samples σημαίνει ότι η γενεολογική έρευνα πάει 3-4 γενιές πίσω τουλάχιστον στο point of reference, μέσω μελέτης αρχείων, είναι δύσκολη η συλλογή τους και γι'αυτό αργούν πολύ. Και ναί υπάρχουν και άλλα samples από άλλες περιοχές της Ελλάδας.

Τα αρχαιογενετικά samples επίσης τα ανεβάζουν από τα ίδια ερευνητικά. Τα Μυκ. είναι όλα του Λαζαρίδη, τώρα θα δημοσιευθεί στα κοντά καινούργιο paper από Russel Grant για Μυκ. σκελετούς στην Στερεά και Πελοπ. με R1b-Z2103 haplo, άργησε λόγω ιού.

Δεν υπάρχει 'Βουλγάρικο' γονιδίωμα, αυτό που έγραψα είναι ότι στα Principal Component Analysis, οι Μακεντόνετς πέφτουν πάνω στο Βουλγάρικο cluster.

[Maejima]

Στο 1000genomes χρειάζεσαι genome browser.

Σε αυτές τις βιβλιοθήκες βρίσκονται σε τυπική μορφή (.vcf).

http://www.sanger.ac.uk/resources/downl ... pmap3.html

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/ ... c=GSE22494

https://www.internationalgenome.org/

http://www.evolutsioon.ut.ee/MAIT/caucasus_data/

http://dienekes.blogspot.com/2011/12/po ... -asia.html

http://hagsc.org/hgdp/files.html

Για να μην ψάχνεις, μπές στον eurogenes και δές τα τροποποιημένα files σε G25 για χρήση στο VahaduoJ.

https://eurogenes.blogspot.com/2019/07/ ... 25_12.html

Κάνε copy-paste στον browser τα data για το Principal Component Analysis.

Εδώ μπορείς να το κάνεις και plot σε γράφημα:

https://vahaduo.github.io/g25views/

[Σέλευκας]

Εχουν χαθεί πολλά ποστ

[sys3x]

Εχουν χαθεί πολλά ποστ

Δε χάθηκε το πχώρουμ όμως.

[Κόκκορας]

εντωμεταξυ εβλεπα μια ταινια με τον λαμπρο κωνστανταρα και εψαξα το βιογραφικο του
απο κωνσταντινουπολη και σινωπη ποντου οι ριζες του

[Σέλευκας]

εντωμεταξυ εβλεπα μια ταινια με τον λαμπρο κωνστανταρα και εψαξα το βιογραφικο του
απο κωνσταντινουπολη και σινωπη ποντου οι ριζες του

Στα ποστ μου που χάθηκαν για τους Ποντιους ειχα τη φωτογραφια του

[Σέλευκας]

Λαθος μου. Δεν χάθηκαν τα ποστ. Ειναι σε άλλο νήμα.

[Κόκκορας]

δεν το γνωριζα πως εχει ριζες απο ποντο
τον περικλη χριστοφοριδη ηξερα πως ειναι απο ποντο,γεννηθηκε μαλιστα τραπεζουντα.

EDIT ναι αυτο θα σου ελεγα μηπως ειναι σε εκεινο με τους κυπριους,πως λεγοταν

[Pogol]

Θα είχε ενδιαφέρον να ξέρουμε, τι ποσοστό από τους Έλληνες αποίκους, έχουν οι σημερινοί Πόντιοι.
Έκανα τεστ απλοομάδας (βγήκε G, τι έκπληξη...) στο Genographic Project (του National Geographic). Άραγε, ένα τεστ στα αυτοσωμικά γονίδια, πόσο να κοστίζει, και τι συμπεράσματα για την καταγωγή μπορεί να δώσει;

ΥΓ: σχετικά με την αντιπαράθεση Μακεντόνσκι-Ποντίων. Αν έρχονταν αύριο στην Μακεδονία, ελληνόφωνοι και χριστιανοί Παπούα (φαινότυπος), πάλι θα είχαν προτεραιότητα εγκατάστασης έναντι των Σλάβων.

[Σέλευκας]

Ο Αδωνης απ την πλευρα του πατέρα του είναι από την Κλεισούρα Καστοριάς (και παππούς και γιαγιά). Ενα βλαχόφωνο χωριό το οποίο πριν εγκατασταθούν οι Βλάχοι μετά την δίωξη του Αλι Πασά ήταν ελληνόφωνο. Βλάχοι και ντόπιοι ανακατεύτηκαν και υπερίσχυσε το βλαχικό στοιχείο.
Ο παππούς του απο μητέρα λεγόταν Σπύρος Βλασσόπουλος και ήταν Αθηναίος.

[Panticapaeum]

Γενετική:

Καταρχάς, θα χρησιμοποιήσουμε την ανοιχτή βάση ακαδημαϊκών γενετικών δειγμάτων του 1000 genomes, για να εξετάσουμε τη γενετική συγγένεια και των Ποντίων αλλά και των Σλαβομακεδόνων. Βοηθός μας είναι το στατιστικό πρόγραμμα nmonte runner VahaduoJ.
https://www.internationalgenome.org/
https://vahaduo.github.io/vahaduo/

Για να δούμε τα αποτελέσματα του μοντέλου μας.



Η κάτω από 3% distance στη γενετική απόσταση μας δείχνει σχεδόν ένα native αποτέλεσμα, δηλαδή μία σχεδόν τέλεια συσχέτιση.

Οι Πόντιοι, λοιπόν, μπορούν να δομηθούν ώς ένας συνδυασμός 60% Καυκάσου (το Γεωργιανό δείγμα επιλέχθηκε ώς ο πιο “ατόφιος” νοτιο-Καυκάσιος πληθυσμός) και 40% Ελλήνων Κρητών (ο πιο κοντινός ελληνικός πληθυσμός στα Μυκηναϊκά δείγματα, σύμφωνα με αποτελέσματα έρευνας του Χάρβαρντ, Lazaridis et al. (2017)), κάτι που αποδεικνύει και ότι γνωρίζουμε από την Ιστορία για την πορεία των Ιώνων αποίκων της Μαύρης Θάλασσας.

SpoilerShow

Το συγκεκριμενο model είναι ατελές. Χρειάζονται να μπούνε κι άλλοι πληθυσμοί.