Σε αντιθεση με το Ελληνικο Γυμνασιο του Παπα Λεοντος Ι' που ειχε καθαρα αναγεννησιακο χαρακτηρα το Ποντιφικο Κολλεγιο του Αγιου Αθανασιου ειχε ξεκαθαρα προσηλυτιστικο χαρακτηρα.Σενέκας έγραψε: ↑13 Ιουν 2024, 19:26Αν δεν κάνω λάθος είχαμε και πατριάρχες οι οποίοι ήταν απόφοιτητοι του Κολλεγίου του Αγίου Αθανασίου της Ρώμης, ούτε αυτοί ήταν πειραγμένοι δογματικάGeorge_V έγραψε: ↑13 Ιουν 2024, 19:21Και στην Κυπρο και στην Κρητη.
Αλλα εκει ηταν Βενετσιανικες κτησεις. Εντελως αλλο καθεστως.
Στην Κυπρο ο Παπας Κλημης Δ' κατάργησε την Κυπριακη Ιεραρχια και τους αφησε μονο 4 Επισκοπους (κατι που διατηρηθηκε μεχρι το 1974) με την Bulla Cypria.
Στα δε Επτάνησα οι Ανδεγαυοι κατάργησαν πληρως της Ελληνικες Επισκοπες και τις αντικατέστησαν με Λατινικες και οι Ορθοδοξοι περιοριστηκαν μονο στους Μεγάλους Πρωτοπαπαδες μεχρι το 1800 που πηραν πουλο οι Βενετσιανοι.
Οι φοιτητες του ηταν κατα βασιν Κυπριοι που εκλατινιζονταν και επεστρεφαν να προσηλυτισουν και αλλους στον Καθολικισμο. Οσοι δεν αλλαζαν δογμα αποβαλλονταν απο τη σχολη.